特色学科
【特色学科】英語科を設置している高校
英語科は、英語を理解し、英語で表現する能力を養うとともに、言語に対する関心を深め、外国の社会・文化に対する深い理解を図り、国際理解の基礎を習得することを目指す学科。
中野西高校（中野市）
岡谷南高校（岡谷市）
松本県ヶ丘高校（松本市）
【特色学科】理数科を設置している高校
理数科は、自然科学・数学の基礎的概念、原理・法則等についての系統的な理解を深め、科学的・数学的に考察・処理する能力・態度を育てる学科。
飯山北高校（飯山市）
屋代高校（更埴市）
野沢北高校（佐久市）
伊那北高校（伊那市）
飯田高校（飯田市）
木曽青峰高校（木曽町）
大町高校（大町市）
【特色学科】国際教養科・国際文化科を設置している高校
国際教養科・国際文化科は、外国語によるコミュニケーション能力を育てるとともに、わが国や外国の文化に対する理解を深め、国際社会で活躍できる人材の育成を目指す学科。
長野西高校（長野市）
上田染谷丘高校（上田市）
軽井沢高校（軽井沢町）
飯田風越高校（飯田市）
【特色学科】体育科を設置している高校
体育科は、高度のスキー技術の習得や外国人講師を活用した語学教育等を内容とする教育課程を編成し、スキー技術の向上に貢献する人材の育成、国際化等社会の進展に対応しうる人材の育成を目指す学科。
飯山高校（飯山市）
【特色学科】音楽科を設置している高校
音楽科は、音楽に関する専門的な学習を通して、創造的な表現に必要な知識や技術を習得し、音楽に対する豊かな感性を養い、音楽文化の発展に寄与する態度を育てる学科。
小諸高校（小諸市）
総合学科設置校
総合学科は、学年ごとに定められていた必修科目中心の従来の履修方法と異なり、普通科目・専門科目にわたって用意された多くの科目の中から生徒自身が自らの学習希望や進路希望に応じて選択して履修する方法に比重を置く教育課程。
中野立志館高校（中野市）
丸子修学館高校（上田市）
蘇 南 高 校（南木曽町）
塩尻志学館高校（塩尻市）
