後期選抜の募集人員は、各高校の総募集定員から前期選抜の入学確約書の提出者数を除いた数になります。
平成21年度の後期選抜の学力検査等は、平成21 年３月10 日（火）に実施され、合格発表は、平成21 年３月19 日（木）に行われます。
学力検査の時間割は、すでに発表されており、
１時限 国 語 9:35～10:25(50 分) 休憩15 分
２時限 数 学 10:40～11:30(50 分) 休憩15 分
３時限 社 会 11:45～12:35(50 分) 昼食60 分
４時限 理 科 13:35～14:25(50 分) 休憩15 分
５時限 英 語 14:40～15:30(50 分)
となっています。
入学者の選抜は、学力検査（５教科500点満点）と内申書をもとに決定します。なお、高校・学科によっては面接、志願理由書（自己PR文）、作文（小論文）、実技検査などが合否判定に加わる場合もあります。
合否判定においては、学科ごとに、受験者全員について、調査書に記載されている中学３年次の評定合計値（9教科×5段階評価＝満点45 点）を縦軸、入試時の学力検査（満点500 点）を横軸とする相関図をまず作成します。
その上で、募集人員を考慮して基準人員を設けます。縦軸について基準人員の数に相当するポイントが区分線の上部の区域に含まれるよう第一区分線を設け、横軸について基準人員の数に相当するポイントが区分線の右側の区域に含まれるよう第二区分線を設けることにより四領域に区分します。
なお、専門学科において、必要な場合は、２教科につき最大で２倍の範囲内で特定の教科に比重を置いた傾斜配点を実施することができます。その場合、相関図の横軸は傾斜配点による学力検査成就率合計値となります。
